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198彩最大总代,人体是由不同基因组拼接而成的

发布时间: 2019-06-12        来源:未知    浏览次数:

198彩票注册 体是由不同基因组
 
 
根据一项对29种不同类型组织的全面调查,人体是由具有不同基因组的细胞簇组成的复杂马赛克,而这些细胞簇中的许多都带有可能导致癌症的突变。
 
这是迄今为止规模最大的此类研究,收集了来自约500人的数千个样本的数据。这项研究结果发表在6月6日的《科学》杂志上,它可以帮助科学家更好地理解癌症是如何开始的,以及如何更早地发现癌症。
 
“我们现在意识到我们是马赛克,我们身体中的大量细胞已经携带了癌症突变,”英国欣克斯顿韦康桑格研究所的遗传学家Inigo Martincorena说。“这些都是癌症的种子。”
 
组织嵌合是由于细胞积累突变而产生的——这些突变来自于细胞分裂过程中悄悄进入的DNA错误,或者是由于暴露于环境因素,如紫外线或香烟烟雾。当一个具有特定突变的皮肤细胞分裂时,它可以产生一块与其相邻细胞在基因上不同的皮肤。
 
以前的研究已经发现皮肤、食管和血液中存在高度的嵌合现象。这些结果通常是从显微镜下组织样本的特定基因测序中获得的。
 
复杂的模式
 
这些研究引起了波士顿麻省总医院计算生物学家盖德·盖兹的注意。Getz和他的团队决定采取一种不同的方法:他们将从基因型组织表达(GTEx)项目中挖掘一个包含rna序列数据的数据库,而不是从微小的样本中对DNA进行测序。由于人体使用DNA作为模板来生成RNA序列,DNA的突变有时会反映在RNA中。
 
研究RNA的决定使Getz和他的同事们能够快速获取从大约500人的29个组织中提取的6700个样本的数据。但是他们的方法也有缺点。不是所有的DNA编码RNA,所以不是所有的DNA突变都会在RNA序列中明显。由于用于GTEx项目的样本相对较大,来自具有独特基因组的小细胞簇的DNA签名可能会被数量多得多的其他细胞所淹没。
 
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细胞分裂率高的组织,如构成皮肤和食道的组织,比细胞分裂率低的组织具有更多的嵌合现象。嵌合现象也随着年龄的增长而增加,在肺和皮肤组织中尤其普遍,这些组织暴露在环境因素中,会破坏DNA。
 
微妙的信号
 
一种名为TP53的基因是最常见的突变位点之一。TP53有助于修复DNA损伤,被称为“基因组的守护者”。TP53的某些变化与癌症有关,但在细胞产生肿瘤之前,可能需要其他基因的额外突变。
 
加拿大温哥华不列颠哥伦比亚省癌症研究所的癌症基因组学专家Erin Pleasance说:“我们所看到的是一些最早的癌前病变,它们会积累更多的突变。”“最终,其中一小部分可能会变成癌症。”
 
马里兰州巴尔的摩约翰·霍普金斯医学院的应用数学家克里斯蒂安·托马塞蒂说,研究人员现在需要找到方法来区分哪些细胞会变成肿瘤,哪些是“正常的”。这对于提高早期发现癌症的努力可能是至关重要的。
 
托马塞蒂已经开发出检测血液中循环的肿瘤DNA的方法,研究人员希望有一天可以用来发现癌症的早期迹象。但他说,他的团队最初惊讶地发现,他们的研究结果中的一些突变来自一组正常血细胞。这些突变与癌症有关,因此可能表明存在肿瘤。
 
“这种混乱的局面是新的常态,”托马塞蒂说。“现在的挑战是弄清楚,在什么程度上我们称之为正常。”
 
 
 
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