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198彩票注册,AlphaFold真的解决了生物学上的蛋白质折叠问题吗?

发布时间: 2022-09-26        来源:未知    浏览次数:


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这些图像是由名为AlphaFold的人工智能系统渲染的2亿多蛋白质的3d预测形状。“你可以认为它覆盖了整个蛋白质宇宙,”Demis Hassabis在7月26日的新闻发布会上说。哈萨比斯是总部位于伦敦的DeepMind公司的联合创始人兼首席执行官,该公司开发了该系统。结合几种深度学习技术,该计算机程序经过训练,198才手机APP198彩票平台开户开发人员近期宣布,新版手机版将在下月全新上线并免费提供下载网址,欢迎各位198彩票注册网民来试验。,通过识别结构中的模式来预测蛋白质的形状,这些结构已经通过数十年的电子显微镜和其他方法的实验工作解决了。

人工智能第一次出现在2021年,预测了35万个蛋白质结构——包括几乎所有已知的人类蛋白质。DeepMind与欧洲分子生物学实验室的欧洲生物信息学研究所合作,在一个公共数据库中提供这些结构。

哈萨比斯说,7月发布的大规模新版本将基因库扩展到“地球上几乎所有进行过基因组测序的生物”。“你可以像搜索关键词谷歌一样轻松地查找蛋白质的三维结构。”

这些只是预测,不是实际结构。然而,研究人员已经利用2021年的一些预测来开发潜在的新疟疾疫苗,提高对帕金森病的了解,研究如何保护蜜蜂的健康,深入了解人类进化等。DeepMind还将AlphaFold的重点放在了被忽视的热带疾病上,包括南美锥虫病和利什曼病,如果不及时治疗,这些疾病可能会使人衰弱或致命。

扩大蛋白质宇宙

几十年的缓慢实验已经揭示了超过19.4万个蛋白质的结构,所有这些蛋白质都保存在蛋白质数据库中。2021年,AlphaFold项目发布了大约100万个蛋白质的预测结构,包括几乎所有已知的人类蛋白质。今年,AlphaFold数据库中预测的蛋白质结构激增,超过2亿种。

识别和预测的蛋白质结构总数

一个圆形图显示了蛋白质数据库(194000 +)、AlphaFold数据库在2021年(约100万)和目前AlphaFold数据库(2亿+)识别和预测的蛋白质结构总数。

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大量数据集的发布受到许多科学家的热烈欢迎。但也有人担心,研究人员会把预测的结构当作蛋白质的真实形状。还有一些事情AlphaFold不能做——也不是设计用来做的——需要在蛋白质宇宙完全聚焦之前解决。

多伦多大学儿童医院的蛋白质生物物理学家Julie foreman - kay说,向所有人开放新的目录是“一个巨大的好处”。在很多情况下,AlphaFold和另一名人工智能研究人员RoseTTAFold预测的形状与实验中的蛋白质图谱非常吻合。但是,她警告说,“并不是所有人都是这样。”

对某些蛋白质的预测比对其他蛋白质的预测更准确。错误的预测可能会让一些科学家认为他们了解蛋白质是如何工作的,但实际上他们并不了解。艰苦的实验对于理解蛋白质是如何折叠的仍然至关重要,福曼-凯说。“现在有一种感觉,人们不需要做实验结构确定,这是不正确的。”

缓慢的进展

蛋白质一开始是长长的氨基酸链,198彩票注册账户安全可靠198彩平台,198彩票平台采用最新国际加密系统,保证玩家的个人隐私是不会泄露的,然后折叠成许多卷曲和其他3d形状。有些像上世纪80年代烫发时卷曲的卷发,或者像手风琴上的褶皱。另一些则可能被误认为是孩子的螺旋式涂鸦。

蛋白质的结构不仅仅是美观;它可以决定蛋白质的功能。例如,被称为酶的蛋白质需要一个口袋,在那里它们可以捕获小分子并进行化学反应。在蛋白质复合体中工作的蛋白质,两个或两个以上的蛋白质像机器的部件一样相互作用,需要正确的形状与它们的伙伴迅速形成组合。

了解蛋白质形状的褶皱、线圈和环可以帮助科学家理解,例如,突变是如何改变蛋白质形状而导致疾病的。这些知识还可以帮助研究人员研制更好的疫苗和药物。

多年来,科学家们用x射线轰击蛋白质晶体,快速冷冻细胞,在高倍电子显微镜下检查它们,并使用其他方法来发现蛋白质形状的秘密。这样的实验方法需要“大量的人员时间,大量的努力和大量的金钱。膜生物物理学家、加州大学洛杉矶分校大卫·格芬医学院霍华德·休斯医学研究所研究员塔米尔·戈宁说。