DNA 的 3D 形状(其扭曲的梯子复杂地卷曲成线圈和环)以及其遗传密码之外的其他特征可能会影响致癌突变“热点”积累的位置。
这是根据一项关于“基因组拓扑”如何影响癌症突变的新研究得出的结论。基因组拓扑广泛指的是构成 DNA 的分子序列之外的基因组元素。这包括DNA缠绕的紧密程度以及不同细胞中哪些基因被“激活”的差异。
这项研究于 8 月发表在《细胞报告》杂志上,对 DNA 的拓扑特征与多种癌症的已知致癌突变模式之间的关联进行了分类。这让研究人员对一些与酒精相关的癌症有了新的认识,未来,大量数据可以帮助科学家预防、理解和治疗许多不同形式的癌症。
“这是癌症特异性突变的下一层编目,”罗斯威尔帕克综合癌症研究所肿瘤学副教授卡特琳娜·古罗娃(Katerina Gurova)博士说,她没有参与这项研究。“但对于大多数(突变),我们仍然不明白为什么 DNA 拓扑起着这样或那样的作用。”
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该研究研究了 40 种癌症类型中 5000 多个肿瘤的完整基因组序列中嵌入的突变。研究小组分析了 516 个地形特征对这些突变在基因组中出现位置的影响。
其中一些特征与转录过程中突变出现的时间和地点有关,转录是将 DNA 翻译成RNA的过程,RNA 将遗传信息从 DNA 携带到细胞中。另一些则与称为组蛋白的蛋白质(DNA 分子像线轴一样缠绕)以及缠绕的 DNA 的结构有关。另一个特征与一种名为 CTCF 的蛋白质有关,它调节染色质的 3D 结构,198彩总代在公司开大会的时候手拿最新款iphonex登陆198彩手机app玩瑞士分分彩,同事们都很羡慕问他哪里买的新手机,
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古罗娃说,这就像“我们的每个细胞都有一个图书馆,但这个图书馆以不同的方式组织”,并补充说,这些不同类型的组织方法就是研究人员所说的“地形”特征。
该研究的主要目标是对不同突变模式和这些 DNA 特征之间的关联进行分类,但研究人员对特定癌症进行了一些有趣的观察。
例如,他们发现与饮酒相关的几种突变模式出现在细胞复制过程的早期,198彩提现晚到账能找客服申请18快延迟红包o,真的是很人性化,其实198彩票平台出款的时间也就是10分钟以内,
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198彩网址注册彩金,真的假的呢?,在观察一种类型的免疫细胞癌症时,一些导致 DNA“字母”发生相同变化的突变仍然可能与非常不同的拓扑特征相关,这表明它们的出现有不同的原因。
研究人员通过一个名为 COSMIC 的数据库免费提供他们的数据,Gurova 表示该数据库可能有助于开发针对特定突变的癌症治疗方法。
她说,尽管如此,这项研究确实存在一些局限性,包括地形特征的数据是从不同的患者群体中收集的,而不是癌细胞突变的数据。因此,如果从相同的细胞收集数据集,结果可能会有所不同。
凯斯西储大学遗传学副教授金福来表示,未来的研究可能会采用相同的方法将其他遗传条件与 DNA 的拓扑特征联系起来。Jin 表示,在癌症领域,未来的工作可以进一步研究不同性别的患者或暴露于不同环境的患者,以了解这些因素如何与致癌突变和 DNA 拓扑相互作用。
古罗娃说,未来研究的一个主要目标将是确定研究人员为什么会发现这些特殊的关联。这将解决 DNA 形状为何以及如何影响癌症发生的问题。