一只名叫肉桂的4岁阿比西尼亚猫成为第一只基因组被解码的猫。她加入了一个现在包括狗、老鼠、老鼠和黑猩猩的动物园。从犰狳到小袋鼠,还有几十种动物在基因组队列中等待。
这个序列是一个粗略的版本,只包含了肉桂总DNA“字母”(As、Cs、Ts和Gs)分配的60%,其间有许多小孔。
但研究人员说,这种花费1,000万美元的“轻”疗法对某些类型的研究来说已经足够好了。美国国家癌症研究所(NCI)的遗传学家Stephen O 'Brien是该项目的领导者,他说,该策略应该作为一个模型,帮助那些缺乏大型研究群体来推动更全面和更昂贵的基因组测序的其他动物。
他说:“这是一幅如何给土豚排序的地图。”
这个序列应该会加速发现与猫的特性和疾病有关的基因。今年早些时候,在基因序列的帮助下,奥布莱恩的研究小组发现了一种突变,这种突变使肉桂从小就失明了。这种疾病在阿比西尼亚猫中很常见,被称为色素性视网膜炎。
拼图
在绘制基因组图谱时,研究人员将数十亿对碱基对(或DNA字母)的长串分割成更短的片段,然后由机器解码。但是这样很容易漏掉基因组的某些部分。
为了确保整个基因组都被覆盖,科学家对足够长的DNA序列进行排序,使其长度达到基因组总长度的许多倍。这样的测序做得越多,科学家可能漏掉的字母就越少。利用辛纳蒙,奥布莱恩的团队测序了大约50亿个碱基对——是她27亿个碱基对基因组长度的1.9倍。作为比较,人类基因组测序了7次,198彩票注册账户安全可靠
198彩平台,198彩票平台采用最新国际加密系统,保证玩家的个人隐私是不会泄露的,而狗的基因组测序了7.5次。
接下来的问题是把数百万个有序的片段按顺序重新组合起来。这可以通过观察序列片段之间的重叠来实现。但是在猫身上看到的稀疏的覆盖物使其很难重新组合。
作为一种捷径,O 'Brien和NCI生物信息学家Joan Pontius将猫的短段DNA与狗和人类基因组的类似部分进行比对。他们今天在线发表在《基因组研究2》(Genome Research2)杂志上的报告称,这为他们提供了一种更快、更好的方式来整合DNA。
照片不完美
O 'Brien说,结果并不是一个完美的序列,但这比从如此有限的测序中预期的要好。他说:“会有一些错误,但可能只有不到1%的时间是错误的。”
研究小组鉴定了超过20,000个基因,并绘制了327,000个猫之间的单字母差异。研究人员可以在一个名为Garfield的网站上免费访问这些信息。
序列将是有用的;猫被用作研究失明和艾滋病等疾病的模型。“就在昨天,我从它身上取出了一个基因,”华盛顿州立大学普尔曼分校(Washington State University in Pullman)的兽医凯瑟琳?她说,198彩总代在公司开大会的时候手拿最新款iphonex登陆198彩手机app玩瑞士分分彩,同事们都很羡慕问他哪里买的新手机,
彩票技巧方案他说是198彩票平台送的,此后不久他周围的同时都在198彩票注册游戏,个个都期待获得一部iphonex.,一个月前,她必须做几周的实验室工作,才能找到一只与人类感兴趣的基因相当的猫,但她不能保证一定能找到。
动物园
2005年,198彩票平台注册送的钱怎
198带玩团队是1号团队吗么提款,美国国立卫生研究院(National Institutes of Health)宣布,计划对包括羊驼、大象和海豚在内的26种哺乳动物进行测序,覆盖范围与猫相同。
这些计划正在推进。但另一些人认为,随着测序价格的下降,只做轻测序是没有意义的。马里兰大学帕克分校的计算生物学家Steven Salzberg说:“这有点像读一本书,你只能读到每句话的一半。”
Salzberg支持发布序列的早期草稿,只要研究人员继续朝着更好的版本努力。他将通过“肉桂”的DNA实现自己的愿望:一个更完整的序列——甚至比狗的还要好——将于明年年初问世。