虽然“进化树”的概念起源于达尔文的《物种起源》,但我们可以把这个概念应用到任何进化的事物上,包括病毒。科学家可以通过研究SARS-CoV-2的进化来进一步了解病毒基因的功能。推断病毒在世界各地的传播情况,以及哪种疫苗可能最有效,也是很有用的。
我是一名生物信息学家,研究流行病和病毒进化之间的关系。我现在是研究SARS-CoV-2进化的众多研究人员之一,因为它可以帮助研究人员和公共卫生官员跟踪病毒的传播。我们发现,SARS-CoV-2病毒的变异速度似乎比季节性流感慢,而季节性流感可能使科学家研制出一种疫苗。
病毒通过变异进化。也就是说,随着时间的推移,198彩平台黑钱吗,从没听过198彩黑钱的消息
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我们可以把生物遗传物质想象成一个字母序列,随着时间的推移,序列发生突变:序列的字母可以改变。科学家们开发了各种序列进化模型,以帮助他们研究突变是如何随着时间发生的。
就像我们的电话游戏一样,SARS-CoV-2病毒的基因组序列也会随着时间的推移而改变:突变是随机发生的,一个特定病毒中发生的任何变化都会遗传给下一代的所有副本。然后,就像我们可以尝试破译“猫”是如何变得“疯狂”的一样,科学家们可以使用基因进化的模型来尝试确定病毒最有可能的进化史。
DNA测序是一个实验过程,找出一段DNA的核苷酸序列(A、C、G和T)——基因的化学组成部分。DNA测序在很大程度上被用于研究人类疾病和遗传学,但近年来,测序已经成为病毒点护理的一个常规部分,随着测序变得越来越便宜,随着时间的推移,病毒测序将变得更加频繁。
RNA是一种类似于DNA的分子,它本质上是DNA短片段的临时拷贝。具体来说,在生物学的中心法则中,DNA被转录成RNA。SARS-CoV-2是一种RNA病毒,这意味着我们的DNA测序技术不能直接解码它的序列。然而,科学家们可以先将病毒的RNA反转录成互补DNA (cDNA),然后对其进行测序。
给定一组病毒基因组序列,我们可以使用序列进化模型来预测病毒的历史,我们可以用它来回答诸如“突变发生的速度有多快?”或者“突变在基因组的什么地方发生?”了解哪些基因经常发生突变可能对药物设计有用。
追踪一个地方的病毒是如何变化的也可以回答这样的问题,“在我的社区里有多少不同的病毒爆发?”这类信息可以帮助公共卫生官员控制病毒的传播。
对于COVID-19,
,已经有了一项与所有科学家共享病毒基因组的全球倡议。给定一个带有样本日期的序列集合,科学家可以实时推断样本的进化历史,并使用这些信息来推断传输历史。
其中一个项目是Nextstrain,这是一个开源项目,为用户提供季节性流感、埃博拉病毒和许多其他传染性疾病传播的实时报告。最近,他们在COVID-19的进化跟踪方面走在了前列,他们提供了一个实时的分析和一份形势报告,198彩总代在公司开大会的时候手拿最新款iphonex登陆198彩手机app玩瑞士分分彩,同事们都很羡慕问他哪里买的新手机,
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随着可用信息数量的增长,科学家需要更快的工具来处理这些数据。我在加州大学圣地亚哥分校的实验室,与系统能源效率合作(见)教授领导的实验室TajanaŠimunić罗辛,正在努力创建新的算法、软件工具和计算机硬件的实时分析COVID-19流行更为可行。
关于这种流行病,我们了解到了什么?
根据目前的数据,SARS-CoV-2的变异速度似乎比季节性流感慢得多。具体来说,SARS-CoV-2的突变率每年少于25个突变,而季节性流感的突变率每年将近50个突变。
考虑到SARS-CoV-2基因组几乎是季节性流感基因组的两倍,似乎季节性流感的突变速度大约是SARS-CoV-2的四倍。事实上,季节性流感突变如此之快恰恰是它能够避开我们的疫苗的原因,因此,SARS-CoV-2突变率的显著降低给我们带来了开发有效持久疫苗的希望。